בית מדרש 'גמרא באמונה' נועד לתת קומה נוספת באמונה על גבי הלימוד הישיבתי הרגיל. בכדי לברר כיצד ניתן לצמוח מבחינה רוחנית ואישית מתוך הלימוד וליישמו בחיינו. כל הדברים נעשים מתוך בירור יסודי ועמוק לאור דברי חז"ל ורבותינו הראשונים והאחרונים.
קהל היעד של בית המדרש מגוון מאוד ומיועד לכל המחפשים קומה אמונית וקיומית לנלמד ומעוניינים לעבוד את ה' מתוך שמחה וחדוות לימוד התורה. החל מר"מים בישיבות תיכוניות המחפשים דרכים להלהיב את התלמידים בלימוד הגמרא, ועד ללומדי הדף היומי והציבור הרחב.
ייחודיות נוספת בבית מדרשנו היא איחוד האורות הרבים הנמצאים בבתי המדרש השונים החל מתורת הרב קוק, למדנות ישיבתית ועד לחסידות.